本系於民國五十八年五月十七日奉教育部核准創立，現有大學部、碩士班和博士班。本系坐落於府城臺南的國定古蹟成大文學院舊館，是全臺唯一擁獨立系館的歷史系。

本系在 1970 年代曾與美國哈佛大學燕京學社合作，進行臺灣史研究，為國內各大學臺灣史研究先驅。教學相長的史蹟勘考活動，蒐集許多臺灣歷史文物，部分收藏於「成功大學歷史文物館」。

本系師資陣容堅強，研究與教學領域多元——以地理區域涵蓋臺灣、中國、東北亞、東南亞、中東、希臘、羅馬、英國、法國、愛爾蘭、德國等；研究主題涉及經濟史、社會史、宗教史、思想史、藝術史、婦女史、影視史學、口述歷史、歷史教育、史學理論、公眾史學、生態史等領域。